Центр САТР активно сотрудничает с ведущими вузами и экспертными организациями в области специальной педагогики и психологии. В разработке образовательных программ принимают участие преподаватели и научные сотрудники КазНПУ им. Абая, ЖенПИ, а также другие авторитетные специалисты — корифеи специальной педагогики, психологии и инклюзивного образования.
Особое значение имеет участие педагогов‑практиков и исследователей специальных организаций образования Республики Казахстан, которые вносят ценный опыт работы с детьми с особыми образовательными потребностями и помогают адаптировать программы к реальным условиям образовательного процесса.
Совместная работа с ведущими учёными, практиками-исследователями обеспечивает высокое качество образовательных программ, актуальность методик и их практическую ценность для педагогов.